Το οικοσύστημα της καινοτομίας στην Κρήτη είναι αρκετά ώριμο και πρωτοπόρο σε σχέση με την υπόλοιπη χώρα, αλλά και άλλες ανεπτυγμένες οικονομίες του ευρωπαϊκού Νότου.